Οι λόγοι που ευθύνονται για την ημικρανία ποικίλλουν, ωστόσο ως βασικότεροι θεωρούνται τα γονίδια, οι ορμόνες, η έλλειψη και η κακή ποιότητα ύπνου, το στρες και η κακή διατροφή.